Καθώς ολοκληρώνονται όλο και περισσότερα μεγάλης κλίμακας έργα αλληλουχίας του ανθρώπινου γονιδιώματος, οι επιστήμονες μπόρεσαν να εντοπίσουν με αυξανόμενη εμπιστοσύνη τόσο τα γεωγραφικά κινήματα όσο και τις γενετικές παραλλαγές των ανθρώπινων πληθυσμών. Τα περισσότερα από αυτά τα έργα ευνόησαν τη μελέτη των ευρωπαϊκών πληθυσμών και, ως εκ τούτου, λείπουν από την εκπροσώπηση της πραγματικής εθνοτικής ποικιλομορφίας σε ολόκληρο τον κόσμο.
Για να κατανοήσουμε καλύτερα το ευρύ δημογραφικό ιστορικό του προ-ισπανικού Μεξικού και να αναζητήσουμε υπογραφές της προσαρμοστικής εξέλιξης, μια διεθνής ομάδα με επικεφαλής Μεξικανών επιστημόνων έχει αναλύσει τις πλήρεις περιοχές κωδικοποίησης πρωτεϊνών του γονιδιώματος ή εξόδων 78 ατόμων από πέντε διαφορετικούς ιθαγενείς ομάδες από τη Βόρεια (Rara? muri ή Tarahumara, και Huichol), Κεντρική (Nahua), Νότια (Triqui, ή TRQ) και Νοτιοανατολικά (Maya, ή MYA) Μεξικό. Η γονιδιωματική μελέτη, η μεγαλύτερη του είδους της για ιθαγενείς πληθυσμούς από την Αμερική, εμφανίστηκε πρόσφατα στην προηγμένη ηλεκτρονική έκδοση του Molecular Biology and Evolution .
"Σχεδιάσαμε το δημογραφικό ιστορικό των αυτοχθόνων πληθυσμών από το Μεξικό με τις βόρειες και νότιες εθνοτικές ομάδες (Tarahumara και Huichol) χωρίζοντας 7,2 kya και στη συνέχεια αποκλίνουσες τοπικά 6,5 kya (ομάδες Huichol) και 5,7 kya (Triqui και Maya) Μαρία Άβιλα-Άρκος, του Εθνικού Αυτόνομου Πανεπιστημίου του Μεξικού. Τα Nahua εξαιρέθηκαν από την τελική ανάλυση λόγω του θορύβου που έφερε στη συνολική ανάλυση
Συνολικά, εντόπισαν 120.735 παραλλαγές απλού νουκλεοτιδίου (SNV) μεταξύ των ατόμων που μελετήθηκαν, τα οποία χρησιμοποιήθηκαν για την ανίχνευση του ιστορικού του πληθυσμού. Επιπλέον, μπόρεσαν να συνδυάσουν τα δεδομένα τους με το δημογραφικό ιστορικό και τα απολιθωμένα αρχεία των προγονικών Αμερικανών.
"Οι χρόνοι διαχωρισμού που βρήκαμε είναι επίσης συνεπείς με τις προηγούμενες εκτιμήσεις των προγονικών ιθαγενών Αμερικανών που αποκλίνουν ~ 17,5-14,6 KYA σε Southern Native Americans ή" Προγονικό Α ", που περιλαμβάνει τους κεντρικούς και νότιους αμερικανούς Αμερικανούς) και τους Βόρειους Αμερικανούς ή" Προγονικό Β " με μια αρχική εγκατάστασή του στο Μεξικό που συνέβη πριν από τουλάχιστον 12.000 χρόνια, όπως πρότειναν τα αρχαιότερα σκελετικά λείψανα που χρονολογούνται περίπου σε αυτήν την ηλικία και βρίσκονται στο κεντρικό Μεξικό και στη χερσόνησο Γιουκατάν ", δήλωσε ο Άβιλα-Άρκος. "Μελέτες σχετικά με δεδομένα γενετικού τύπου από αρχαία κατάλοιπα από την Κεντρική και Νότια Αμερική αποκαλύπτουν γενετική συνέχεια μεταξύ αρχαίων και σύγχρονων πληθυσμών σε ορισμένα μέρη της Αμερικής τα τελευταία 8500 χρόνια."
"Αυτό υποδηλώνει ότι μέχρι τότε ο προγονικός πληθυσμός της MYA δεν ήταν ακόμα γενετικά διαφοροποιημένος από τους άλλους, οπότε οι εκτιμήσεις μας για το βόρειο / νότιο διαχωρισμό σε 7,2 KYA και Mayan / Triqui απόκλιση στα 5,7 KYA ταιριάζουν με αυτό το σενάριο.
Έπειτα, σαρώθηκαν τα δεδομένα για να προσδιορίσουν τα υποψήφια γονίδια που είναι πιο σημαντικά για την προσαρμογή.
"Είναι ενδιαφέρον ότι ορισμένα από αυτά τα γονίδια είχαν προηγουμένως εντοπιστεί ως στόχοι επιλογής σε άλλους πληθυσμούς", δήλωσε ο αντίστοιχος συγγραφέας Andres Moreno Estrada, κύριος ερευνητής στο Εθνικό Εργαστήριο Γονιδιωματικής για τη Βιοποικιλότητα (LANGEBIO) - UGA, CINVESTAV
Αυτά τα γονίδια περιλαμβάνουν το SLC24A5, που εμπλέκονται στην αποχρωματισμό του δέρματος και το FAP, το οποίο είχε προηγουμένως προταθεί να είναι υπό προσαρμοστική αρχαϊκή παρεκτροπή στους Περουβιανούς και στους Μελανησιανούς. Τρία γονίδια εμπλέκονται στην ανοσολογική αντίδραση. Αυτές περιλαμβάνουν το SYT5, που εμπλέκονται στην έμφυτη ανοσοαπόκριση και τις ιντερλευκίνες IL17A και IL13. Τα υπόλοιπα υποψήφια γονίδια εμπλέκονται στη μεταγωγή σήματος (MPZL1), την εντοπισμό και μεταφορά πρωτεΐνης (GRASP και ARFRP1), τη διαφοροποίηση των κυττάρων και τη σπερματογένεση (GMCL), τη οργάνωση συσκευών Golgi (UBXN2B), τη διαφοροποίηση των νευρώνων (MANF), τη σηματοδότηση και τη συστολή των καρδιακών μυών ADRBK1), τον κυτταρικό κύκλο (CDK5), την οργάνωση και τη σταθεροποίηση των μικροσωληνίσκων (NCKAP5L) και τον σχηματισμό ινών στρες (NCKIPSD).
Δύο γονίδια ξεχώρισαν για την ομάδα. Αυτές περιλάμβαναν το BCL2L13, το οποίο εκφράζεται έντονα στους σκελετικούς μυς και μπορεί να σχετίζεται με τη φυσική αντοχή, συμπεριλαμβανομένης της μεγάλης απόστασης μεγάλης αντοχής, ένα γνωστό χαρακτηριστικό του βόρειου Μεξικού Rara-muri. Το γονίδιο KBTBD8 έχει συσχετιστεί με ιδιοπαθή σύντομο ανάστημα (που βρέθηκε επίσης σε Κορεάτες) και η ομάδα το βρήκε πολύ διαφοροποιημένο στο Triqui, μια νότια ομάδα ιθαγενών από την Οαχάκα, η οποία είναι εξαιρετικά χαμηλή σε σχέση με άλλους ιθαγενείς πληθυσμούς.
"Διεξήγαμε τον πληρέστερο χαρακτηρισμό της δυνητικά προσαρμοστικής λειτουργικής διακύμανσης σε αυτόχθονες πληθυσμούς από την Αμερική μέχρι σήμερα", δήλωσε ο Moreno Estrada. "Προσδιορίσαμε σε αυτούς τους πληθυσμούς πάνω από τέσσερις χιλιάδες νέες παραλλαγές, οι περισσότεροι από τους οποίους ήταν singletons, με ουδέτερο, ρυθμιστικό, καθώς και σχολιασμό πρωτεϊνών και missense. Ο μέσος αριθμός singletons ανά άτομο ήταν υψηλότερος σε Nahua (NAH) και Maya (MYA ), η οποία αναμένεται δεδομένου ότι αυτές οι δύο ιθαγενείς ομάδες ενσωματώνουν τους απογόνους των μεγαλύτερων πολιτισμών στη Μεσοαμερική και ότι σήμερα οι γλώσσες Ναχουά και Μάγια είναι οι πλέον ομιλούμενες ιθαγενείς γλώσσες στο Μεξικό Επιπλέον,
Πηγή: Πανεπιστημιακός Τύπος της Οξφόρδης
 |
Για να κατανοήσουμε καλύτερα το ευρύ δημογραφικό ιστορικό του προ-ισπανικού Μεξικού και να αναζητήσουμε υπογραφές της προσαρμοστικής εξέλιξης, μια διεθνής ομάδα με επικεφαλής Μεξικανών επιστημόνων ανέλυσε τις πλήρεις περιοχές κωδικοποίησης πρωτεϊνών του γονιδιώματος ή εξόδων 78 ατόμων από διαφορετικές ιθαγενείς ομάδες από το Μεξικό. Η μελέτη γονιδιώματος είναι η μεγαλύτερη του είδους για τους αυτόχθονες πληθυσμούς από την Αμερική [Credit: Ruben Mendoza, Εθνικό εργαστήριο γονιδιωματικής για τη βιοποικιλότητα (LANGEBIO) - UGA, CINVESTAV] |
"Σχεδιάσαμε το δημογραφικό ιστορικό των αυτοχθόνων πληθυσμών από το Μεξικό με τις βόρειες και νότιες εθνοτικές ομάδες (Tarahumara και Huichol) χωρίζοντας 7,2 kya και στη συνέχεια αποκλίνουσες τοπικά 6,5 kya (ομάδες Huichol) και 5,7 kya (Triqui και Maya) Μαρία Άβιλα-Άρκος, του Εθνικού Αυτόνομου Πανεπιστημίου του Μεξικού. Τα Nahua εξαιρέθηκαν από την τελική ανάλυση λόγω του θορύβου που έφερε στη συνολική ανάλυση
Συνολικά, εντόπισαν 120.735 παραλλαγές απλού νουκλεοτιδίου (SNV) μεταξύ των ατόμων που μελετήθηκαν, τα οποία χρησιμοποιήθηκαν για την ανίχνευση του ιστορικού του πληθυσμού. Επιπλέον, μπόρεσαν να συνδυάσουν τα δεδομένα τους με το δημογραφικό ιστορικό και τα απολιθωμένα αρχεία των προγονικών Αμερικανών.
"Οι χρόνοι διαχωρισμού που βρήκαμε είναι επίσης συνεπείς με τις προηγούμενες εκτιμήσεις των προγονικών ιθαγενών Αμερικανών που αποκλίνουν ~ 17,5-14,6 KYA σε Southern Native Americans ή" Προγονικό Α ", που περιλαμβάνει τους κεντρικούς και νότιους αμερικανούς Αμερικανούς) και τους Βόρειους Αμερικανούς ή" Προγονικό Β " με μια αρχική εγκατάστασή του στο Μεξικό που συνέβη πριν από τουλάχιστον 12.000 χρόνια, όπως πρότειναν τα αρχαιότερα σκελετικά λείψανα που χρονολογούνται περίπου σε αυτήν την ηλικία και βρίσκονται στο κεντρικό Μεξικό και στη χερσόνησο Γιουκατάν ", δήλωσε ο Άβιλα-Άρκος. "Μελέτες σχετικά με δεδομένα γενετικού τύπου από αρχαία κατάλοιπα από την Κεντρική και Νότια Αμερική αποκαλύπτουν γενετική συνέχεια μεταξύ αρχαίων και σύγχρονων πληθυσμών σε ορισμένα μέρη της Αμερικής τα τελευταία 8500 χρόνια."
"Αυτό υποδηλώνει ότι μέχρι τότε ο προγονικός πληθυσμός της MYA δεν ήταν ακόμα γενετικά διαφοροποιημένος από τους άλλους, οπότε οι εκτιμήσεις μας για το βόρειο / νότιο διαχωρισμό σε 7,2 KYA και Mayan / Triqui απόκλιση στα 5,7 KYA ταιριάζουν με αυτό το σενάριο.
Έπειτα, σαρώθηκαν τα δεδομένα για να προσδιορίσουν τα υποψήφια γονίδια που είναι πιο σημαντικά για την προσαρμογή.
"Είναι ενδιαφέρον ότι ορισμένα από αυτά τα γονίδια είχαν προηγουμένως εντοπιστεί ως στόχοι επιλογής σε άλλους πληθυσμούς", δήλωσε ο αντίστοιχος συγγραφέας Andres Moreno Estrada, κύριος ερευνητής στο Εθνικό Εργαστήριο Γονιδιωματικής για τη Βιοποικιλότητα (LANGEBIO) - UGA, CINVESTAV
Αυτά τα γονίδια περιλαμβάνουν το SLC24A5, που εμπλέκονται στην αποχρωματισμό του δέρματος και το FAP, το οποίο είχε προηγουμένως προταθεί να είναι υπό προσαρμοστική αρχαϊκή παρεκτροπή στους Περουβιανούς και στους Μελανησιανούς. Τρία γονίδια εμπλέκονται στην ανοσολογική αντίδραση. Αυτές περιλαμβάνουν το SYT5, που εμπλέκονται στην έμφυτη ανοσοαπόκριση και τις ιντερλευκίνες IL17A και IL13. Τα υπόλοιπα υποψήφια γονίδια εμπλέκονται στη μεταγωγή σήματος (MPZL1), την εντοπισμό και μεταφορά πρωτεΐνης (GRASP και ARFRP1), τη διαφοροποίηση των κυττάρων και τη σπερματογένεση (GMCL), τη οργάνωση συσκευών Golgi (UBXN2B), τη διαφοροποίηση των νευρώνων (MANF), τη σηματοδότηση και τη συστολή των καρδιακών μυών ADRBK1), τον κυτταρικό κύκλο (CDK5), την οργάνωση και τη σταθεροποίηση των μικροσωληνίσκων (NCKAP5L) και τον σχηματισμό ινών στρες (NCKIPSD).
Δύο γονίδια ξεχώρισαν για την ομάδα. Αυτές περιλάμβαναν το BCL2L13, το οποίο εκφράζεται έντονα στους σκελετικούς μυς και μπορεί να σχετίζεται με τη φυσική αντοχή, συμπεριλαμβανομένης της μεγάλης απόστασης μεγάλης αντοχής, ένα γνωστό χαρακτηριστικό του βόρειου Μεξικού Rara-muri. Το γονίδιο KBTBD8 έχει συσχετιστεί με ιδιοπαθή σύντομο ανάστημα (που βρέθηκε επίσης σε Κορεάτες) και η ομάδα το βρήκε πολύ διαφοροποιημένο στο Triqui, μια νότια ομάδα ιθαγενών από την Οαχάκα, η οποία είναι εξαιρετικά χαμηλή σε σχέση με άλλους ιθαγενείς πληθυσμούς.
"Διεξήγαμε τον πληρέστερο χαρακτηρισμό της δυνητικά προσαρμοστικής λειτουργικής διακύμανσης σε αυτόχθονες πληθυσμούς από την Αμερική μέχρι σήμερα", δήλωσε ο Moreno Estrada. "Προσδιορίσαμε σε αυτούς τους πληθυσμούς πάνω από τέσσερις χιλιάδες νέες παραλλαγές, οι περισσότεροι από τους οποίους ήταν singletons, με ουδέτερο, ρυθμιστικό, καθώς και σχολιασμό πρωτεϊνών και missense. Ο μέσος αριθμός singletons ανά άτομο ήταν υψηλότερος σε Nahua (NAH) και Maya (MYA ), η οποία αναμένεται δεδομένου ότι αυτές οι δύο ιθαγενείς ομάδες ενσωματώνουν τους απογόνους των μεγαλύτερων πολιτισμών στη Μεσοαμερική και ότι σήμερα οι γλώσσες Ναχουά και Μάγια είναι οι πλέον ομιλούμενες ιθαγενείς γλώσσες στο Μεξικό Επιπλέον,
Πηγή: Πανεπιστημιακός Τύπος της Οξφόρδης
Επισκεφτείτε την ιστοσελίδα μας http://www.tapantareinews.gr, για περισσότερη ενημέρωση. ⭐Εγγραφείτε - SUBSCRIBE: http://bit.ly/2lX5gsJ Website —►http://bit.ly/2lXX2k7 SOCIAL - Follow us...: Facebook...► http://bit.ly/2kjlkot
Δημοσίευση σχολίου
Αφήστε το σχόλιό σας ή κάνετε την αρχή σε μία συζήτηση
Σημείωση: Μόνο ένα μέλος αυτού του ιστολογίου μπορεί να αναρτήσει σχόλιο.